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Cell:婴儿双歧杆菌全球图谱,重塑物种分类与益生菌设计

发布日期:2026-03-02 浏览次数:

Cell

[IF:42.5]
Genomic atlas of Bifidobacterium infantis and B. longum informs infant probiotic design
Cell.2026-02-18;doi:10.1016/j.cell.2026.01.007.


1.背景与设计:针对长双歧杆菌婴儿亚种(婴儿双歧杆菌,BI)商业菌株缺乏全球代表性的问题,本研究整合来自48个国家的4098个基因组,构建全球图谱。


2.核心发现与意义:该资源将中低收入国家的BI代表性提升12-17倍,并确立BI与长双歧杆菌(BL)为独立物种,揭示其地理分布与代谢功能的高度分化,为开发基于地区特异性菌株的下一代精准益生菌提供蓝图。


3.分类重构:系统发育与全基因组平均核苷酸同一性(ANI)分析支持将BI从亚种提升为独立物种,并将BL划分为3个亚种(含1个新亚种)。


4.分布特征:BI在中低收入国家婴儿中占主导,但在高收入国家婴儿中罕见,而BL在后者及全球成人中占主导。


5.功能与地理分化:BL主要富集植物聚糖代谢通路;而BI不仅富集母乳底物利用基因(尿素、B族维生素、母乳低聚糖),还形成各大洲特异性谱系,具有适应当地植物聚糖传统饮食的代谢基因。


6.益生菌资源与工具:商业BI菌株缺乏野生菌株的多样性与关键代谢功能;筛选出36个来自中低收入国家地区的候选菌株,并设计了高特异性PCR引物。


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